Porównanie trzech sekwencji kodujących aktynę u myszy; związki ewolucyjne między genami aktynowymi kręgowców stałocieplnych.
-
-
- Określiliśmy sekwencje trzech zrekombinowanych cDNA komplementarnych do różnych mRNA aktyny myszy, które zawierają ponad 90% sekwencji kodujących i pełne lub częściowe regiony 3′ nieulegające translacji (3’UTR): pAM 91, komplementarny do mRNA aktyny wyrażanego u dorosłych mięsień szkieletowy (aktyna alfa sk); pAF 81, komplementarny do mRNA aktyny, który jest akumulowany w mięśniu szkieletowym płodu i jest głównym transkryptem w mięśniu sercowym dorosłego człowieka (aktyna alfa c); i <em>pAL</em> 41, zidentyfikowany jako komplementarny do mRNA aktyny beta niemięśniowej na podstawie jego sekwencji 3’UTR. Podobnie jak w przypadku innych gatunków, sekwencje białkowe tych izoform są wysoce konserwatywne (ponad 93%), ale trzy mRNA wykazują znaczną rozbieżność (13,8-16,5%) w cichych pozycjach nukleotydów w ich regionach kodujących.
- Region nukleotydowy położony w kierunku końca 5′ wykazuje znacznie mniejszą rozbieżność (5,6-8,7%) wśród trzech mRNA aktyny myszy; drugi region, w pobliżu końca 3′, również wykazuje mniejszą rozbieżność (6,9%), w tym przypadku między mysimi mRNA aktyny beta i alfa sk. Proponujemy, że zdarzenia rekombinacyjne między sekwencjami aktyny mogły zhomogenizować te regiony. Takie zdarzenia zniekształcają obliczone odległości ewolucyjne między sekwencjami w obrębie gatunku. Wykorzystanie kodonów w trzech mRNA aktyny jest wyraźnie różne i wskazuje, że nie ma ścisłego związku między typem tkanki, a tym samym pulą prekursorów tRNA, a wykorzystaniem kodonów w tych i innych badanych mRNA mięśniowych.
- Analiza wykorzystania kodonów w tych sekwencjach kodujących u różnych gatunków kręgowców wskazuje na dwie tendencje: wzrost tendencji do stosowania G i C w trzeciej pozycji kodonu w porównaniach paralogicznych (w kolejności alfa c mniej niż beta mniej niż alfa sk) oraz w porównaniach ortologicznych (w kolejności kurczak mniej niż gryzoń mniej niż człowiek).
- Porównanie sekwencji kodujących aktynę między gatunkami przeprowadzono przy użyciu metody analizy Perlera. W miarę cofania się w czasie zmiany w cichych miejscach najpierw szybko się kumulują, potem zaczynają się nasycać po -(30-40) milionach lat (MY), a właściwie zmniejszają się między -400 a -<em>500</em> roku.
- Zamienniki lub ciche substytucje nie mogą zatem być używane jako zegary ewolucyjne dla tych sekwencji w długich okresach czasu. Inne zjawiska, takie jak konwersja genów lub kompartmentalizacja izochorów, prawdopodobnie zniekształcają szacowany czas dywergencji.
Olanzapina kontra aprepitant w zapobieganiu nudnościom i wymiotom wywołanym chemioterapią: randomizowane badanie III fazy.
- Celem pracy było porównanie skuteczności olanzapiny (OLN) i aprepitantu (APR) w zapobieganiu nudnościom i wymiotom wywołanym chemioterapią (CINV) u pacjentów otrzymujących chemioterapię o silnym działaniu wymiotnym.
- Badanie III fazy przeprowadzono u pacjentów nieleczonych wcześniej chemioterapią, otrzymujących cisplatynę ≥ 70 mg/m(2) lub cyklofosfamid ≥ <em>500</em> mg/m(2) i doksorubicynę ≥ 50 mg/m(2), porównując OLN do APR w połączeniu z palonosetronem (<em>PAL</em>) i deksametazonem (DEX). Schematy OLN, <em>PAL</em>, DEX (OPD) obejmowały 10 mg doustnej OLN, 0,25 mg dożylnie <em>PAL</em> i 20 mg dożylnej prechemioterapii DEX, dzień 1. i 10. mg/dzień samej doustnej OLN w dniach 2-4 po chemioterapii.
- Schematy APR, <em>PAL</em>, DEX (APD) obejmowały 125 mg APR doustnego, 0,25 mg <em>PAL</em> i.v. i 12 mg DEX i.v., dzień 1. i 80 mg doustnego APR, dni 2 i 3 oraz 4 mg DEX BID, dni 2-4. Dwustu pięćdziesięciu jeden pacjentów wyraziło zgodę na protokół i zostało zrandomizowanych. Dwustu czterdziestu jeden pacjentów podlegało ocenie.
- Odpowiedź całkowita (CR) (brak wymiotów, brak ratunku) wyniosła 97% dla okresu ostrego (24 godziny po chemioterapii), 77% dla okresu opóźnionego (2-5 dni po chemioterapii) i 77% dla całego okresu (0-120 godzin) dla 121 pacjentów otrzymujących schemat OPD. CR wyniosło 87% w ostrym okresie, 73% w opóźnionym okresie i 73% w całym okresie u 120 pacjentów otrzymujących schemat APD.
- Pacjenci bez nudności (0, skala 0-10, MD Anderson Symptom Inventory) byli OPD: 87% ostra, 69% opóźniona i 69% ogółem; APD: 87% ostra, 38% opóźniona i 38% ogółem. Nie było toksyczności 3 lub 4 stopnia. CR i kontrola nudności w kolejnych cyklach chemioterapii były równe lub większe niż cykl 1 dla obu schematów. OPD była porównywalna z APD w kontroli CINV. Nudności były lepiej kontrolowane przez OPD.
- W tym badaniu OLN w połączeniu z pojedynczą dawką DEX i pojedynczą dawką PAL był bardzo skuteczny w kontrolowaniu ostrego i opóźnionego CINV u pacjentów otrzymujących chemioterapię o silnym działaniu wymiotnym. Odsetki CR nie różniły się istotnie od podobnej grupy pacjentów otrzymujących chemioterapię o silnym działaniu wymiotnym i schemat przeciwwymiotny składający się z APR, PAL i DEX.
Horyzontalny transfer genów będący źródłem metabolizmu fenylopropanoidów: kluczowa adaptacja roślin do gleby.
Pionierski przodek roślin lądowych, które podbiły siedliska lądowe około <em>500</em> lat temu, musiał stawić czoła dramatycznym stresom, w tym promieniowaniu UV, wysuszeniu i atakowi drobnoustrojów.Doprowadziło to do szeregu adaptacji, wśród których kluczowe znaczenie miało pojawienie się szlaku fenylopropanoidowego, prowadzącego do niezbędnych związków, takich jak flawonoidy i lignina. Jednak pochodzenie tego specyficznego wtórnego metabolizmu roślin lądowych nie zostało wyjaśnione.Przeprowadziliśmy obszerną analizę dystrybucji taksonomicznej i filogenezy liazy amonowej fenyloalaniny (PAL), która katalizuje pierwszy i niezbędny etap ogólnego szlaku fenylopropanoidowego, prowadzącego od fenyloalaniny do kwasu p-kumarowego i p-kumaroilo-CoA, wpis punkty szlaków flawonoidowych i ligninowych.Uzyskaliśmy solidne dowody na to, że przodek roślin lądowych nabył PAL poprzez horyzontalny transfer genów (HGT) podczas symbiozy z bakteriami glebowymi i grzybami, o których wiadomo, że zadomowiły się bardzo wcześnie podczas pierwszych etapów kolonizacji lądu. Ten poziomo nabyty PAL stanowił wówczas podstawę do dalszego rozwoju szlaku fenylopropanoidowego i promieniowania roślin w środowiskach lądowych.Nasze wyniki podkreślają możliwą kluczową rolę HGT z bakterii glebowych na ścieżce prowadzącej do kolonizacji gleby przez rośliny i ich późniejszej ewolucji. Nieliczne charakterystyki funkcjonalne osadu/gleby bakteryjnej PAL (produkcja metabolitów wtórnych o silnej aktywności przeciwdrobnoustrojowej lub wytwarzanie pigmentów) sugerują, że początkową zaletą tej horyzontalnie nabytej PAL u przodka roślin lądowych mogła być obrona przed już rozwiniętym drobnoustrojem społeczność i/lub ochrona przed promieniowaniem UV.Czy donory tlenku azotu naśladują endogenną odpowiedź związaną z NO u roślin?
- Ogromny postęp osiągnięty w ostatnim czasie w wyjaśnianiu roli NO w roślinach był możliwy dzięki zastosowaniu donorów NO. Jednak aplikowanie roślinom NO w różnych formach i dawkach powinno podlegać szczegółowym kryteriom weryfikacji. Nie wszystkie odpowiedzi metaboliczne indukowane przez dawców NO są wiarygodne i powtarzalne w innych projektach eksperymentalnych.
- Celem prezentowanych badań było zbadanie okresu półtrwania najczęściej stosowanych dawców (SNP, SNAP i GSNO), szybkości uwalniania NO pod wpływem światła oraz czynników redukujących. Przy porównywalnym stężeniu dawców (<em>500</em> mikroM) iw warunkach oświetlenia najwyższy wskaźnik generowania NO stwierdzono dla SNAP, a następnie GSNO i SNP.
- Zmierzony okres półtrwania dawcy w roztworze wynosił 3 h dla SNAP, 7 h dla GSNO i 12 h dla SNP . Chwilowy brak światła hamował uwalnianie NO z SNP, zarówno w roztworze, jak i w tkance liścia poddanej działaniu SNP, co mierzono metodą elektrochemiczną. Również NO, selektywny wskaźnik fluorescencji DAF-2DA w liściach od różnych dawców wykazywał zielone plamki fluorescencji w komórkach naskórka, głównie w świetle.
- SNP jako dawca NO był najbardziej światłoczuły. Aktywność <em>PAL</em>, która odgrywa ważną rolę w obronie roślin, została również aktywowana przez SNP w świetle, a nie w ciemności. S-nitrozotiole (SNAP i GSNO) również uległy fotodegradacji, choć w mniejszym stopniu niż SNP.
- Dodatkowo wykazano zdolność generowania NO z S-nitrozotioli w obecności czynników redukujących, tj. kwasu askorbinowego i GSH, oraz braku światła.
pal Antibody
1-CSB-PA340792HA01LNY Cusabio - 317.00 EUR
- 335.00 EUR
- 100ug
- 50ug
MYK-461
A8720-25 ApexBio 25 mg 1442 EUR MYK-461
A8720-5 ApexBio 5 mg 456 EUR MYK-461
A8720-5.1 ApexBio 10 mM (in 1mL DMSO) 409 EUR Mouse antibody for Strep pneumoniae common
461 Virostat 100 ug 321.88 EUR 500 BlotBot Reagent Reservoirs
RRVR-500 Next Advance 500pack 534 EUR UPCK Buffer Kit - 500
UPBK-500 Biotech Support Group 500 mL 615 EUR HemoVoid Buffer Kit - 500
HVBK-500 Biotech Support Group 500 mL 615 EUR AlbuVoid Buffer Kit - 500
AVBK-500 Biotech Support Group 500 mL 615 EUR PAL-KTTKS (PAL-Lys-Thr-Thr-Lys-Ser)
CP-53886 Alpha Diagnostics 5 mg 286 EUR (Ac-PAL)2R110
13467 AAT Bioquest 1 mg 132 EUR Fmoc-Pal-Linker
5-02209 CHI Scientific 1g Ask for price Fmoc-Pal-Linker
5-02210 CHI Scientific 5g Ask for price pal Polyclonal Antibody
A64382 EpiGentek 100 µg 570.55 EUR PAL CAM BROTH
P16-124-10kg Alphabiosciences 10 kg 1180 EUR PAL CAM BROTH
P16-124-2kg Alphabiosciences 2kg 296 EUR PAL CAM BROTH
P16-124-500g Alphabiosciences 500 g 117 EUR ERLENMEYER FLASK, 500 ML, PP
4985P-500 CORNING 6/pk 64 EUR ERLENMEYER FLASK, 500 ML, PMP
4990P-500 CORNING 6/pk 92 EUR WASH BOTTLE 500 ML, LDPE
1300P-500 CORNING 12/pk 81 EUR REAGENT BOTTLE,500 ML, PP
1500P-500 CORNING 10/pk 62 EUR DBCO-PEG-Biotin,500
HE048041-500-100mg Biochempeg 100mg 765 EUR pal Antibody, HRP conjugated
1-CSB-PA340792HB01LNY Cusabio - 317.00 EUR
- 335.00 EUR
- 100ug
- 50ug
pal Antibody, FITC conjugated
1-CSB-PA340792HC01LNY Cusabio - 317.00 EUR
- 335.00 EUR
- 100ug
- 50ug
pal Antibody, Biotin conjugated
1-CSB-PA340792HD01LNY Cusabio - 317.00 EUR
- 335.00 EUR
- 100ug
- 50ug
Anserini PAL ELISA Kit
EAP0604 Abclonal 96Tests 521 EUR Rat PAL ELISA Kit
ERP0604 Abclonal 96Tests 521 EUR Rabbit PAL ELISA Kit
ERTP0604 Abclonal 96Tests 521 EUR Mouse PAL ELISA Kit
EMP0604 Abclonal 96Tests 521 EUR Porcine PAL ELISA Kit
EPP0604 Abclonal 96Tests 521 EUR Human PAL ELISA Kit
EHP0604 Abclonal 96Tests 521 EUR Canine PAL ELISA Kit
ECP0604 Abclonal 96Tests 521 EUR Bovine PAL ELISA Kit
EBP0604 Abclonal 96Tests 521 EUR Goat PAL ELISA Kit
EGTP0604 Abclonal 96Tests 521 EUR Boc-2-Pal-OH
5-03771 CHI Scientific 5g Ask for price Boc-2-Pal-OH
5-03772 CHI Scientific 25g Ask for price Fmoc-2-Pal-OH
5-03773 CHI Scientific 5g Ask for price Fmoc-2-Pal-OH
5-03774 CHI Scientific 25g Ask for price Fmoc-3-Pal-OH
5-03785 CHI Scientific 5g Ask for price Fmoc-3-Pal-OH
5-03786 CHI Scientific 25g Ask for price Fmoc-4-Pal-OH
5-03817 CHI Scientific 5g Ask for price Fmoc-4-Pal-OH
5-03818 CHI Scientific 25g Ask for price Anti-PAM / PAL antibody
STJ71486 St John's Laboratory 100 µg 359 EUR Fmoc-3-Pal-OH
A6711-1000 ApexBio 1 g 108 EUR Fmoc-3-Pal-OH
A6711-100000 ApexBio 100 g 4091 EUR Fmoc-3-Pal-OH
A6711-25000 ApexBio 25 g 1172 EUR Fmoc-3-Pal-OH
A6711-5000 ApexBio 5 g 309 EUR Guinea Pig PAL ELISA Kit
EGP0604 Abclonal 96Tests 521 EUR Boc-D-2-Pal-OH
5-03777 CHI Scientific 5g Ask for price Boc-D-2-Pal-OH
5-03778 CHI Scientific 25g Ask for price Boc-D-3-Pal-OH
5-03789 CHI Scientific 5g Ask for price Boc-D-3-Pal-OH
5-03790 CHI Scientific 25g Ask for price Fmoc-L-4-Pal-OH
20-abx095050 Abbexa - 2082.00 EUR
- 773.00 EUR
- 398.00 EUR
- 100 g
- 25 g
- 5 g
Fmoc-Pal-Linker-Am-Resin
5-07943 CHI Scientific 1g Ask for price Fmoc-Pal-Linker-Am-Resin
5-07944 CHI Scientific 5g Ask for price pal Polyclonal Antibody, HRP Conjugated
A64383 EpiGentek 100 µg 570.55 EUR pal Polyclonal Antibody, FITC Conjugated
A64384 EpiGentek 100 µg 570.55 EUR pal Polyclonal Antibody, Biotin Conjugated
A64385 EpiGentek 100 µg 570.55 EUR Boc-D-3-Pal-OH
A6710-1000 ApexBio 1 g 305 EUR Boc-D-2-Pal-OH
A6712-1000 ApexBio 1 g 110 EUR Boc-D-2-Pal-OH
A6712-100000 ApexBio 100 g 4559 EUR Boc-D-2-Pal-OH
A6712-25000 ApexBio 25 g 1302 EUR Boc-D-2-Pal-OH
A6712-5000 ApexBio 5 g 324 EUR PLGA(50:50)?8K?-PEG-Mal,500
HE086022-500-500mg Biochempeg 500mg 765 EUR Alkyne CPG modifier 500, 500 mg
32860 Lumiprobe 500 mg 193 EUR Legionella pneumophila Peptidoglycan-associated lipoprotein (pal)
1-CSB-EP340792LNY Cusabio - 611.00 EUR
- 309.00 EUR
- 1827.00 EUR
- 939.00 EUR
- 1218.00 EUR
- 397.00 EUR
- 100ug
- 10ug
- 1MG
- 200ug
- 500ug
- 50ug
Legionella pneumophila Peptidoglycan-associated lipoprotein (pal)
1-CSB-EP340792LNYa2 Cusabio - 611.00 EUR
- 309.00 EUR
- 1827.00 EUR
- 939.00 EUR
- 1218.00 EUR
- 397.00 EUR
- 100ug
- 10ug
- 1MG
- 200ug
- 500ug
- 50ug
Escherichia coli Peptidoglycan-associated lipoprotein (pal)
1-CSB-EP364257ENV Cusabio - 611.00 EUR
- 309.00 EUR
- 1827.00 EUR
- 939.00 EUR
- 1218.00 EUR
- 397.00 EUR
- 100ug
- 10ug
- 1MG
- 200ug
- 500ug
- 50ug
Polyclonal Goat Anti-PAM / PAL Antibody
APR12156G Leading Biology 0.1 mg 484 EUR Fmoc-Lys(Pal-Glu-OtBu)-OH
5-06707 CHI Scientific 1g Ask for price Fmoc-Lys(Pal-Glu-OtBu)-OH
5-06708 CHI Scientific 5g Ask for price L-Phenylalanine Ammonia-Lyase (pal) Antibody
20-abx300213 Abbexa - 411.00 EUR
- 1845.00 EUR
- 599.00 EUR
- 182.00 EUR
- 300.00 EUR
- 100 ug
- 1 mg
- 200 ug
- 20 ug
- 50 ug
Recombinant (E.Coli, His-tag) Hepatitis C Virus (HCV) NS3 Genotype-1b
RP-461 Alpha Diagnostics 100 ug 286 EUR Transferrin R / CD71 Recombinant Protein
11-461 ProSci 0.1 mg 542.75 EUR Interleukin 1b Recombinant Protein
96-461 ProSci 0.02 mg 390.5 EUR IL-1alpha Recombinant Protein
90-461 ProSci 50 ug 658.25 EUR Pentraxin 2 Recombinant Protein
91-461 ProSci 0.05 mg 464 EUR Serpin B3 Recombinant Protein
92-461 ProSci 0.05 mg 684.5 EUR miRZip-500 anti-miR-500 microRNA construct
MZIP500-PA-1 SBI Bacterial Streak 684 EUR TFA-Amino modifier CPG 500, 500 mg
31860 Lumiprobe 500 mg 193 EUR FAM CPG 500, 6-isomer, 500 mg
35760 Lumiprobe 500 mg 249 EUR Polyclonal RALDH2 / ALDH1A2 Antibody (aa412-461)
APR13063G Leading Biology 0.05ml 484 EUR Zinc Finger Protein 461 (ZNF461) Antibody
abx036689-100ug Abbexa 100 ug 391 EUR L-Phenylalanine Ammonia-Lyase (pal) Antibody (HRP)
20-abx300214 Abbexa - 411.00 EUR
- 1845.00 EUR
- 599.00 EUR
- 182.00 EUR
- 300.00 EUR
- 100 ug
- 1 mg
- 200 ug
- 20 ug
- 50 ug
L-Phenylalanine Ammonia-Lyase (pal) Antibody (FITC)
20-abx300215 Abbexa - 411.00 EUR
- 1845.00 EUR
- 599.00 EUR
- 182.00 EUR
- 300.00 EUR
- 100 ug
- 1 mg
- 200 ug
- 20 ug
- 50 ug
L-Phenylalanine Ammonia-Lyase (pal) Antibody (Biotin)
20-abx300216 Abbexa - 411.00 EUR
- 1845.00 EUR
- 599.00 EUR
- 182.00 EUR
- 300.00 EUR
- 100 ug
- 1 mg
- 200 ug
- 20 ug
- 50 ug
Measuring Spoon 500
MSP05 Next Advance 25pack 123 EUR mPEG-SH,500
33-MF001003-500 Biochempeg - 259.00 EUR
- 677.00 EUR
- 1g
- 5g
mPEG-COOH?500
33-MF001017-500 Biochempeg - 198.00 EUR
- 494.00 EUR
- 1g
- 5g
mPEG-MAL,500
33-MF001022-500 Biochempeg - 235.00 EUR
- 605.00 EUR
- 1g
- 5g
ZeptoGel (500 mL)
0801195 Zeptometrix 500 mL 327.68 EUR Cellufine A-500
19805 JNC America 500 ml 526 EUR Cellufine A-500
19806 JNC America 5 lt Ask for price Cellufine C-500
19865 JNC America 500 ml 526 EUR Cellufine C-500
19866 JNC America 5 lt Ask for price Cellufine Q-500
19907 JNC America 500 ml 718 EUR Cellufine Q-500
19908 JNC America 5 lt Ask for price Cellufine S-500
21-200 JNC America 100 ml 388 EUR Cellufine S-500
21-201 JNC America 500 ml 697 EUR Cellufine S-500
21-202 JNC America 5 lt Ask for price Przeciwciało pułapkowe Autorzy niniejszego artykułu chcieliby polemizować z powszechnie cytowanym stwierdzeniem, że „dawcy to związki, które samoistnie rozkładają się, aby uwolnić NO” i chcą zwrócić uwagę na fakt, że proces rozkładu dawcy zależy od wielu czynników zewnętrznych. Może być dodatkowo stymulowany lub hamowany przez żywą tkankę roślinną, dlatego konieczne jest uwzględnienie tych aspektów i monitorowanie ilości NO uwalnianego przez dawcę.
-